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Genoma mínima

17 Nov 2016

O Bioinformatics o doutor Doping conta sobre os genes de ancestral comum, apagando os genes de bactérias de Escherichia coli e competição.

O que as abordagens diferentes são à definição da genoma mínima? Como métodos de pesquisa genéticos experimentais implementados que se necessitam?

Há várias aproximações da definição do que é a genoma mínima. Primeiro - é evolutivo. É baseado na filosofia natural que se certo gene estiver presente em todos os organismos, provavelmente não pode fazer sem este gene. Aqui há de fato um engano. Como quando digo que o mesmo gene está presente em vários organismos, a pergunta surge, e como fazem sei que isto é um e o mesmo gene e é tudo um e o mesmo gene, quando está em três genomas diferentes. A definição evolutiva é: acreditamos que isto é um e o mesmo gene, se tinham um ancestral comum e a história deste gene é exatamente a mesma espécie da história, isto é, não houve duplicações, e os genes só diferenciaram-se em consequência de speciation.

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Se cultivar bactérias em um meio, a única fonte de carbono que é, por exemplo, fructose, e matou o transportador fructose ou matou a enzima que catálise a primeira reação da nutrição fructose, tudo no seu ambiente, exceto fructose, nada e a possibilidade o quebrou. E se estiver na mesma glicose de aguaceiro de ambiente, será maravilhoso viver e medrar. Então aqui devemos dizer que os deixaremos cultivar um ambiente rico no qual há tudo de que poderia precisar e considerar a genoma mínima tal ambiente. Portanto as pessoas fazem, e também é a definição razoável. É mais suave do que evolutivo. Isto é, os genes que são absolutamente universais, evolutivamente abaixam do que genes que se necessitam para tal indivíduo apaga-se.

Os experimentos são agora genomas mínimas da maior parte de corridas por Craig Venter, que se implicou na genoma humana, e logo ligou às genomas de bactérias. Aplicado a ideia que na realização portanto tenta vender, eu, francamente, não muito. Como tem esta ideia que devemos fazer aqui uma genoma mínima, e logo lhe acrescentaremos opcionalmente algumas partes e faremos encomendado pelas bactérias, "desenho", do qual precisamos. Realmente não entendo porque se justifica tecnologicamente porque de fato podemos fazê-lo agora. Podemos tomar o E. coli - temos o grupo de tensões tecnológicas - e podem fazer o mesmo. Mas Venter diz que não haverá nada extra. De outro lado, certamente não será nada extra, mas ao mesmo tempo será bastante de mortos.

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